Les trois établissements dolois de bienfaisance, l'hôpital du Saint-Esprit sur-le-Pont, celui de Notre-Dame d'Arans et la maladière furent réunis au début du XVIIe siècle au sein de l'Hôpital Neuf, construit à partir de 1613 sur les plans de Jean Boyvin. En 1663, cet hôpital fut confié aux soeurs hospitalières de Sainte-Marthe de Beaune.

Par ailleurs, en 1698 fut décidée la création d'un hôpital général, destiné à abriter les pauvres mendiants; plusieurs dizaines d'orphelins y étaient hébergés et formés dans un atelier d'apprentissage.

Quatre petites liasses de documents relatives à l'hôpital de Dole sont conservées d'ancienneté aux Archives du Jura sou sles cotes 17Hdep/1 à 4 (anciennement  140H) ; elles ne sont pas classées. Le fonds est conservé aux Archives municiplaes de Dole.

NC Non classé

Archives municipales de Dole

Documents de l'Hôtel Dieu

• Titres généraux, 1601-1789 (1-55). Délibérations du conseil, 1626-1826 (620-632). Petit hôpital de la rue d'Arans et maladrerie, 1483-1691 (56-63). Fondations, donations et testaments, 1497-1787 (64-108, 635). Inventaires et manuels, 1620-1777 (610-619). Biens à Dole, 1506-1781 (118-158).

• Biens à Augerans, Baverans, Belmont, Brevans, Crissey, Gevry, Goux, Gredisans, La Loye, Malange, Menotey, Molay, Parcey, Rainans, Rochefort, Saint-Aubin, Souvans, Tavaux, 1420-1778 (159-304, 314-389, 423-492). Cens, 1685-1799 (493-512). Rentes constituées au profit de l'hôtel-Dieu, 1628-1788 (513-529). Rentes cédées par l'état en l'an X, 1471-1838 (529bis-607). Baux des domaines, 1757-1859 (608, 697).

• Enfants trouvés, 1797-1805 (609). Malades, 1779-1797 (655-668). Militaires hospitalisés, 1672-1855 (669-696).

Etablissements réunis

• Hôpital de La Loye.- Biens à Belmont, Goux, La Loye, Parcey, Souvans, 1547-1774 (305-313).

• Hôpital de Rochefort, 1382-1761 (391-422).
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Fonds de l'hôpital général de la Charité

• Hospices réunis.- Titres généraux, correspondance, comptabilité, 1764-1860 (633-654).